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O artigo tem como objetivo refletir sobre a importância do pensamento complexo e da prática do pesquisador em um processo de pesquisa científica; permitindo o exercício da função profissional de professor/pesquisador; de uma perspectiva interdisciplinar, transdisciplinar e holística. A educação é identificada como um espaço insubstituível para a socialização da ciência, e constitui um eixo fundamental no caminho da transformação do papel profissional docente/pesquisador. A principal contribuição é a proposta de incluir na pós-graduação a ideia central de que, se o método científico oferece todas as possibilidades de superação da lógica reducionista tradicional, sua integração ao pensamento complexo contribui para processos de pesquisa com uma abordagem mais integradora e multidimensional. Por meio de uma revisão documental abrangente, o método interpretativo permite afirmar que a vinculação entre pensamento científico e pensamento complexo não é apenas uma questão teórica, mas também uma questão de renovação paradigmática para o pesquisador. Isso decorre necessariamente de uma vontade de mudança, vista como uma oportunidade de desenvolvimento do aluno, especialmente no nível de pós-graduação. Ela se expressa essencialmente no desenvolvimento, pelos alunos, de processos, habilidades e conhecimentos necessários para analisar e contextualizar os problemas identificados como necessidades no campo do conhecimento e da prática.