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Se evaluó el efecto de dos sistemas de cultivo (casa de vegetación y campo abierto), dos variedades de cebolla (Alvara y Gladalan Brown) y dos métodos de fertilización (fertirriego y fertilización edáfica) sobre la producción y calidad del cultivo de cebolla en Tierras Altas de Chiriquí, Panamá. El estudio se realizó en la Estación Experimental del IDIAP, en Cerro Punta, mediante un diseño factorial 2 × 2 × 2 en franjas divididas, con tres repeticiones. Se analizaron variables relacionadas con la cantidad y peso de bulbos clasificados por calibre (jumbo, grande, mediano, chico y deforme). Debido a la falta de normalidad de los datos, se aplicaron las pruebas no paramétricas de Kruskal-Wallis, prueba post hoc de Dunn y ANOVA de Scheirer-Ray-Hare para el análisis estadístico. Los resultados evidenciaron diferencias significativas (p < 0.05) entre sistemas de cultivo, tratamientos y variedades. La casa de vegetación presentó un desempeño superior al campo abierto, reflejado en mayor rendimiento y mejor calidad comercial de los bulbos. La combinación CVT1V1 (casa de vegetación, fertirriego y variedad Alvara) destacó como la más eficiente, al producir mayor proporción de bulbos, peso y menor incidencia de no comerciales. En contraste, las combinaciones CAT1V2, CAT2V2 y CVT2V2 mostraron los resultados menos favorables en cantidad, peso y calidad. Se concluye que la interacción entre sistema de cultivo, fertilización y variedad influye significativamente en el rendimiento, por lo que la agricultura protegida con la variedad Alvara es una alternativa agronómica eficiente y sostenible para la producción de cebolla.