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El Sistema Electrónico de Información del Expediente Clínico juega un rol fundamental para facilitar mejoras en la atención integral del paciente. En Panamá, se ha implementado el Sistema Electrónico de Información del Expediente Clínico a través de sistema de información de salud (SIS) para la atención de pacientes hospitalizados y ambulatorios en hospitales públicos. La investigación tuvo como objetivo evaluar la implementación del sistema electrónico de información del expediente clínico para identificar los procesos de los servicios de farmacia hospitalaria del país, incorporados en el SIS. Fue un estudio observacional, descriptivo, diagnóstico, exploratorio, transversal en hospitales de la Caja de Seguro Social. Se aplicó una encuesta a profesionales farmacéuticos en tres (3) hospitales de la Caja de Seguro Social. El estudio revela que se dispone de normas de buenas prácticas del sistema electrónico en los hospitales de la seguridad social. Para la atención de los pacientes, en la consulta externa se reciben las prescripciones a través del sistema electrónico; en el área en el hospitalaria se utiliza el sistema de unidosis que aplica la herramienta X-farma, que identifica los medicamentos para el llenado del perfil farmacoterapéutico. Este sistema permite el acceso a los profesionales de la salud, brindando facilidades al profesional farmacéutico, para acceder al registro de las órdenes médicas, intervención farmacéutica, seguimiento farmacoterapéutico y la dispensación de medicamentos al igual que detectar errores de medicación y alertas en el esquema de dosificación. La implementación del SIS aporta beneficios en la farmacoterapia del paciente.